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2023

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科学家研究发现识别miRNA靶标新方法


  来自加拿大多伦多大学分子及医学遗传学、加拿大Health Network大学(University Health Network)、美国耶鲁大学的研究人员公布了一张包含104种人类miRNAs的1597个高可信度的靶标网络,并证明miRNAs与mRNA的配对表达谱(paired expression profiles)可以高精度的识别分辩出功能性miRNA靶向关系。这对于研究生物体中miRNAs的作用功能具有重要的意义。这一研究成果公布在《自然—方法学》(Nature Methods)杂志上。

  微小RNA(microRNA,简称miRNA)是生物体内源长度约为20-23个核苷酸的非编码小RNA,通过与靶mRNA的互补配对而在转录后水平上对基因的表达进行负调控,导致mRNA的降解或翻译抑制。对于miRNAs的研究起始于时序调控小RNA(stRNAs),由于miRNAs在物种进化中相当保守,在植物、动物和真菌中发现的miRNAs只在特定的组织和发育阶段表达,而且这种特异性和时序性,决定了组织和细胞的功能特异性,表明miRNA在细胞生长和发育过程的调节过程中起多种作用,因此miRNA的研究受到了生物学家的广泛关注。

  但是经过了前期的研究,有关哺乳动物体内特异性miRNAs靶标的可靠预测依然存在问题,而这对于了解生物体中miRNAs的作用及作用途径而言意义重大。

  在这篇文章中,研究人员证明利用miRNAs与mRNA的配对表达谱(paired expression profiles)可以高精度的识别分辩出功能性miRNA靶向关系。在2006年纽约大学和加州大学伯克利分校的研究人员通过计算机分析预测出了线虫整个基因组范围的microRNA靶标图谱,目前已可以从PicTar的网站上获得线虫、人类和果蝇的数千个基因组范围的miRNA靶标预测结果,这有助于对不同功能的基因组数据资源进行miRNA靶标预测。